A summary and overview about the mice and rats used in biomedical research, based on a survey of 303 publications.
- C57BL/6 and BALB/c are the main mouse strains.
- Sprague-Dawley and Wistar are the main rat strains.
- The Jackson Laboratory, Charles River Laboratories, Taconic Farms, and Harlan Laboratories are the main suppliers.
- Major research applications are in immunology, oncology, physiology, pathology, and neuroscience.
- Specific strains or ES cell lines can be searched at IMSR database.
- Résumé
- C57BL/6 et BALB/c sont les principales lignées de souris.
- Sprague-Dawley et Wistar sont les principales lignées de rats.
- Les laboratoires Jackson, Charles River, Taconic Farms, et Harlan sont les fournisseurs principaux.
- Les principaux secteurs de recherche utilisant les souris et rats de laboratoire sont l’immunologie, l’oncologie, la physiologie, la pathologie, et la neuroscience.
- Les lignées spécifiques ou les lignées cellulaires ES peuvent être recherchées sur l’ IMSR database.
Les modèles animaux sont des outils indispensables dans la recherche biomédicale. Ils ont été utilisés depuis les débuts de la découverte scientifique et aujourd'hui encore, contribuent grandement à notre compréhension de la fonction des gènes individuels, les mécanismes de différentes maladies, ainsi que l'efficacité et la toxicité de divers médicaments et produits chimiques. Les génomes de plusieurs organismes modèles ont été séquencés, et de nombreux gènes sont conservés entre organismes modèles et humains.
Labome a entrepris une revue de 276 peer review publications sur des modèles animaux pour donner un aperçu des modèles animaux dans des publications (table 1).
animal | lignée | num | fournisseurs | num |
---|---|---|---|---|
souris | C57BL/6 | 116 | ||
The Jackson Laboratory | 68 | |||
Charles River | 18 | |||
Taconic Farms | 9 | |||
Harlan Laboratories | 9 | |||
souris | BALB/C | 26 | ||
The Jackson Laboratory | 10 | |||
Charles River | 6 | |||
Taconic Farms | 5 | |||
Harlan Laboratories | 2 | |||
souris | CD-1 | 8 | ||
souris | SCID | 8 | ||
souris | A/J | 4 | ||
rat | Sprague-Dawley | 9 | ||
rat | Wistar | 6 |
Les publications revues représentent un sous-ensemble aléatoire d'environ 10.000 publications en libre accès que Labome a revu pour les applications utilisant les anticorps. En plus, 48 publications de la revue Science ont été ajoutées. Presque toutes les publications sont de 2008 à 2011.
Les résultats indiquent que la souris est l'animal de laboratoire massivement préféré, les lignées de souris et de rats les plus largement utilisées sont les souris C57BL/6 et BALB/c, les rats Sprague-Dawley et Wistar. D'autres lignées, telles que les souris A/J, CD1 et ICR, ont également été utilisées. La majorité de ces animaux sont fournis par quatre grands fournisseurs, les laboratoires The Jackson Laboratory, Charles River Laboratories, Taconic Farms et Harlan Laboratories. Les modèles animaux mentionnés ci-dessus sont utilisés pour la recherche en immunologie, oncologie, physiologie, pathologie et de plus en plus, en neurosciences.
L'albinisme des rongeurs de laboratoire: La majorité des rongeurs de laboratoire sont albinos, en raison d'une mutation commune du gène tyrosinase dans toutes les lignées de rats de laboratoire albinos [1] et dans au moins une des lignées albinos de la souris [2]. La tyrosinase est une enzyme limitante de la production de mélanine. La prévalence de l'albinisme chez les rongeurs de laboratoire est liée au fait que les premières lignées établies étaient albinos, et que l'albinisme était un marqueur de sélection facile.
La souris est le modèle animal le plus cité dans les publications revues. Parmi les 276 articles, 252 ont cité différentes lignées de souris (avec 18 citant les rats, et une ou deux citant le lapin ou le furet ou le cochon d'Inde, ou le macaque rhésus). Cela n'est pas surprenant, 99% des gènes de la souris ont des équivalents humains. Souris et rat sont relativement peu coûteux à élever et à entretenir. Ils peuvent se reproduire rapidement, ce qui permet aux chercheurs d'étudier la fonction de gènes particuliers à travers plusieurs générations de descendants pendant une période de temps raisonnable. Leurs physiologies et la génétique ont été largement étudiées, et peuvent être facilement comparées à l'homme. Les technologies, telles que les méthodes transgéniques, ont été développées au cours de nombreuses décennies pour étudier la génétique et les fonctions de gènes spécifiques. Des modèles murins de nombreuses maladies humaines ont également été développés pour faire avancer les études sur la pathogenèse de la maladie, et pour évaluer l'efficacité et la toxicité de divers médicaments potentiels.
Lignée | principales caractéristiques | avantages | principales applications |
---|---|---|---|
C57BL/6 | Obtenue par croisement consanguin, noir | lignée stable, reproduction facile | Modèles physiologiques et pathologiques pour les expériences in vivo, lignée de base pour le développement d’animaux transgéniques et congéniques |
BALB/c | Obtenue par croisement consanguin, albinos, immunodéficiente | reproduction facile, susceptible de développer des tumeurs | Production d’hybridome et d’anticorps monoclonaux, modèle pour la recherche sur la thérapie contre le cancer et l’immunologie. |
CD-1 | Obtenue par croisement non consanguin, albinos | variabilité génétique | clonage positionnel, sélection génotypique, test en toxicologie (discutable) |
CB17 SCID | Obtenue par croisement consanguin, albinos | pas de cellules T and B, transplantation de tumeurs | Modèle animal immunodéficient utilisé pour tester de nouveaux traitements contre le cancer et comme hôte pour les tissus du système immunitaire humain. |
Les lignées consanguines, congéniques et les souris transgéniques sur fond génétique consanguin sont couramment utilisées. Une lignée consanguine est définie comme étant une lignée qui a été obtenu par croisement de frères et sœurs sur 20 générations, ainsi les animaux de même souche consanguine sont considérés comme génétiquement identiques. Les lignées congéniques sont obtenues par rétrocroisements répétés avec une lignée consanguine pour sélectionner un marqueur unique sur un minimum de 10 générations. Les lignées les plus citées sont C57BL/6, BALB/c, CD-1, SCID et A/J. Seule CD-1 est une lignée qui n’est pas consanguine.
La lignée C57BL/6, également appelée "C57Black 6" ou simplement "Black 6", a l'avantage d’être une lignée stable et à reproduction facile. C'est aussi la première lignée de souris dont le génome a été entièrement séquencé en 2005, devancée seulement par le génome humain. L’International Mouse Phenotyping Consortium (CGIP), lancé le 29 Septembre 2011, vise à cataloguer la fonction de chaque gène murin dans cette lignée à l’aide de technologies de « knock out ». Les souris C57BL/6 sont utilisées dans trois domaines principaux. Le plus commun est de servir de modèles physiologiques ou pathologiques pour des expériences in vivo. Deuxièmement, elles sont souvent utilisées pour construire des modèles de souris transgéniques. Enfin, les souris C57BL/6 sont utilisées comme lignée de référence pour la génération de lignées congéniques avec des mutations spontanées ou induites.
Parmi les articles revus par Labome, un pourcentage important (au moins 116 publications) cite la lignée de souris C57BL/6. On pense que la souche C57BL/6 continuera d'être la souche préférée, car son génome a été séquencé, et du fait de l'effort concerté de l'analyse fonctionnelle des gènes par CGIP. Bien que l'avantage d'utiliser une lignée "standard" dans la recherche soit apparent, des questions intéressantes ont été soulevées au sujet des inconvénients d'une telle pratique [3].
Le type sauvage, congénique , et transgéniques de souris C57BL / 6 de The Jackson Laboratory ont été utilisées pour étudier le développement des lymphocytes T [4, 5], l'inflammation [6-10], la régulation de PepT1 par le butyrate [11], [12], l'implication du facteur de croissance TGF- b3 dans le développement du palais [13], la fibrose et la cardiomyopathie [14], l'insuffisance cardiaque [15], la fonction plaquettaire [16], les maladies greffon contre hôte [17, 18], la pneumonie précoce [19], diabesity [20, 21], l'effet cardioprotecteur du récepteur aux kinines B 1 [22], l'IL- 17 et IL -22 [23], les dommages du tabagisme [24], la douleur neuropathique chronique [25], l'immunité adaptative [26], nNOS dans les varicosités [27], et le dysfonctionnement de la barrière endothéliale microvasculaire [28]. Les maladies infectieuses et la défense contre les agents pathogènes sont les thèmes centraux de nombreuses publications qui emploient des souris C57BL/6: la pathologie cérébrale du paludisme [29], Legionella pneumophila [30], Citrobacter rodentium [31], le paludisme [32], l’infection par Salmonella enterica entericaserotype [33], l'infection invasive à Salmonella typhimurium [34]. Plus récemment, Narita M et al. ont utilisé C57BL/6J pour étudier la synthèse des protéines sécrétoires [35].
Charles River Laboratories est un autre fournisseur important de souris C57BL/6. Charles River C57BL/6 ont été utilisées pour étudier le modèle rongeur du parasite du paludisme Plasmodium berghei [36], fetuin -A [37], le système endocrinien de la différenciation des cellules des îlots pancréatiques [38], les maladies cholestatiques du foie [39], les transporteurs xénobiotiques [40], fonction de Bmi1 [41], la sensibilité à SD et les déficits neurologiques [42], les marqueurs de méthylation germinales [43], l' infection génitale à HSV-2 [44], et l'expression du gène ATM [45]. Plus récemment, Li et al. ont utilisé des souris mâle adultes C57BL / 6 pour étudier le rôle de PKM -zeta sur l’hypersensibilité à la douleur neuropathique dans le cortex [46] et Oh et al. ont collecté des ovocytes à partir de souris C57BL / 6 [47].
C57BL/6 de Taconic ont été utilisées pour étudier la réponse aiguë et chronique aux stimulants psychomoteurs [48], le rôle de la DPP- IV dans le système immunitaire [49], les syndromes lympho-prolifératifs murins [50], les lymphocytes T cytolytiques effecteurs [51], la fonction des mastocytes [52], et le développement du lignage des lymphocytes NKT [53]. Round JL et al. ont utilisé Taconic Farms C57BL/6 pour étudier le rôle de Bacteroides fragilis dans l'établissement de la symbiose hôte microbienne [54].
Harlan Laboratories C57BL/6 ont été utilisées pour étudier l’ischémie-reperfusion [55], la vaccination contre Mycobacterium tuberculosis [56], l’expression de la neurotrophine [57], la sécrétion de l’IL-1 [58], l'infection de fièvre catarrhale du mouton [59], et l'infection virale persistante et les maladies inflammatoires chroniques [60].
D'autres fournisseurs fournissent des souris C57BL/6 qui ont été utilisées pour étudier l’ECE-1 [61], l'effet de CSE1L/CAS sur les cellules cancéreuses [62], et l'effet de l'ablation de delphilin sur l'induction de la dépression à long terme et l’adaptation de la réponse optocinétique [63], le métabolisme du glucose et des lipides [64]. C57BL/6 avec une uvéorétinite auto-immune expérimentale de Sankyo Laboratory Service Corp ont été utilisées pour étudier la propagation de divers auto-antigènes protéiques de la rétine [65] et pour étudier le rôle de l'estérase D et de la créatine kinase cérébrale comme auto-antigènes rétiniens [66] dans l'uvéite endogène.
Les animaleries académiques ou nationales sont également des fournisseurs. Fogg et al. ont utilisé des souris exprimant l’eGFP au niveau du locus du gène CX3CR1 (Cx3cr1gfp / +) sur la lignée CD45.2 C57BL/6 provenant de l’animalerie de l'Université de René Descartes pour identifier un progéniteur clonogénique de la moelle osseuse [67]. Des souris C57BL/6 d’âge et de sexe identiques du National Cancer Institute ont servi comme souris contrôles sauvage [68]. Les souris C57BL/6.Myd88-/- de l'Université d'Alabama à Birmingham ont été utilisées pour étudier le rôle de l'acide rétinoïque trans dans le développement des lymphocytes T régulateurs [9]. Yi et al. ont effectué des tests de micro poche de cornée de et l'examen histologique dans les souris C57BL -/- 6 de National Rodent Laboratory Animal Resources afin d'identifier un nouveau peptide de l'apolipoprotéine humaine et d'étudier son rôle dans l'angiogenèse et la croissance tumorale [69].
BALB/c est une lignée consanguine albinos, immunodéficiente. Les caractéristiques des souris BALB/c sont une reproduction facile et des variations de poids minimes entre les mâles et les femelles. Un autre point important est la faible incidence des tumeurs mammaires chez les souris BALB / c, mais elles sont très sensibles à des agents cancérigènes, et peuvent développer des tumeurs du poumon, des tumeurs réticulaires, tumeurs rénales et autres. En outre, l'injection d'huile minérale peut facilement induire plasmacytomes dans la lignée BALB/c, et cette lignée a été largement utilisée pour la création d’hybridome et la production d'anticorps monoclonaux. Des souris BALB/c sont utiles pour la recherche en thérapie contre le cancer et l'immunologie.
Parmi les publications revues par Labome, 26 publications ont utilisé des souris BALB/c, pour le développement d’hybridome, la production d'anticorps monoclonaux, la recherche sur les maladies infectieuses, entre autre. Les souris BALB/c ont servi de modèle animal général.
Par exemple, Oakley et al. ont identifié les changements du cerveau dans le paludisme cérébral dans le type de souris BALB/c sauvages du Jackson Laboratory [29]. Takeda et al. ont utilisé des souris BALB/c et (B6 x BALB/c) F1 de Charles River Japon pour étudier le rôle de l’apoptose médiée par le récepteur Death 5 dans les maladies cholestatiques du foie [39], et Ekiert et al. ont étudié l'efficacité de l'anticorps CR 8020 contre les virus du groupe 2 de la grippe dans des souris BALB/c de Charles River Laboratories [70]. Li et al. ont utilisé des femelles BALB/c femelles (Charles River Laboratories) pour démontrer la fonction de SOPB [71]. Capraro et al. ont étudié l'effet des mutations du gène SV5- P / V sur la croissance des virus et des réponses immunitaires adaptatives chez les souris BALB/c (Fredrick Cancer Research et Development Center) [72]. Kendirgi et al. ont étudié les prototypes de vaccins à ADN linéaires contre le virus de type A/H5N1 de la grippe chez les souris BALB / c (Harlan) [73].
Une application courante de la souris BALB/c, comme dans le cas des souris C57BL / 6, est de servir de lignée de référence pour différentes études de déficience génétiques et de knockout. Nurieva et al. ont étudié le rôle de l'IL -21, des lignées TH1, TH2 ou TH17 dans la génération de cellules T helper folliculaires dans des souris BALB / c déficientes en STAT6 et STAT4 de The Jackson Laboratory [4]. Tawara et al. ont étudié le rôle de la sécrétion de cytokines Th2 dans les maladies aiguës greffon contre hôte dans des souris BALB/c (H-2d) femelles déficientes en STAT6 ( The Jackson Laboratory ) [17]. Ramaprakash et al. ont étudié les réponses immunitaires anti-fongiques à Aspergillus fumigatus conidia chez des souris BALB / c ( TLR9 + / +) [74] et Castilow et al. ont utilisé les souris BALB/c IFN- gamma C.129S7 Ifngtm1Ts/J-déficient et les souris BALB/c AnNCr pour étudier les effets de l'interféron gamma au cours d'une infection secondaire RSV [75]. Chung et al. ont utilisé les souris femelles BALB/c J et BALB/c congénique C.C3 TLR-4lps-/lps- et les souris BALB/c sauvage (The Jackson Laboratory) pour étudier l'effet des probiotiques sur le développement de la colite expérimentale utilisant les souris mutantes pour le récepteur Toll-like 4 (TLR -4) (lps-/lps-) [76].
Les souris BALB/c jouent un rôle important dans la recherche oncologique. Arscott et al. ont étudié la suppression de la croissance de neuroblastome par dipeptidyl peptidase IV chez la souris nude BALB/c (nu / nu) [77] et Beauvais et al. ont utilisé des souris BALB/c athymiques nude (de Taconic) pour des études de l'angiogenèse cornéenne [78].
Alors que les souris C57BL/6 et BALB/c soient des lignées consanguines permettant d’établir l'homogénéité génétique, les souris CD-1 se distinguent parmi les souris de recherche les plus couramment utilisées en tant que stock non consanguins (des souris consanguines sont désignées comme des lignées, alors que les souris non consanguines sont appelées stocks). La variabilité génétique dans les modèles animaux non consanguins peut servir comme un avantage dans le clônage positionnel de QTL et la sélection phénotypique ou génotypique d'un caractère spécial. Cependant, l'utilisation de souris CD-1, (et les stocks non consanguins en général) dans des domaines de recherche tels que la toxicologie (sécurité et test d’efficacité), le vieillissement et l'oncologie a été évaluée de façon critique et n’est peut-être pas bénéfique [79]. L'apparence des souris CD-1, est identique à la lignée BALB/c qui sont albinos.
Plusieurs des publications revues par Labome ont utilisé les souris CD-1, principalement des Laboratoires Charles River. Ray et al. ont utilisé des souris femelles adultes CD-1 pour démontrer que l'intégration de la signalisation beta-catenin/Lef-1/Tcf-3 avec ERalpha est nécessaire pour la régulation de gènes endogène dépendant des œstrogènes dans biologie de l'utérus [80]. Tang et al. ont étudié la morphogenèse des tubes du poumon chez les souris CD-1 [81]. Ye et al. ont évalué dispositif de transcription optogénétique synthétique [82]. Les souris CD-1 ont servi de source d'embryons de souris [38], ont été utilisées pour étudier les variants d'épissage CstF-64 [83], et pour étudier l'organogenèse des vertébrés [84]. Ko et al. ont utilisé les souris CD-1 du Jackson Laboratory pour étudier la dégradation de LRRK2 [85].
Les souris CB17 SCID (SCID réfère à immunodéficience combinée sévère) est une lignée albinos avec mutation SCID spontanée. La mutation empêche le développement et la maturation des cellules T et B. Cependant, les souris SCID ont des cellules NK normales, des macrophages et des granulocytes. Ils partagent la même apparence que les souris normales. En raison de la mutation SCID, le taux de réussite de la greffe de tumeur humaine est très élevé (encore plus élevé que les souris Nude), ce qui fait de ces souris un modèle animal immunodéprimé précieux pour tester de nouveaux traitements contre le cancer et comme hôtes pour les tissus du système immunitaire humain.
La souris A/J est un autre modèle albinos commun, avec des caractéristiques uniques telles que l’apparition tardive de la dystrophie musculaire progressive et la fente palatine congénitale induite par l’hormone surrénalienne. De plus, ces souris présentent une forte incidence d'adénomes pulmonaires spontanés, et cette tumeur peut facilement se développer en réponse à des agents cancérigènes.
Labome a revu 4 publications utilisant les souris A/J comme modèles animaux. Takeda et al. ont utilisé les souris A/J (Japan SLC) pour étudier le rôle de l’apoptose médiée par le récepteur Death 5 dans les maladies cholestatiques du foie [39]. Les souris A/J du laboratoire Jackson ont été utilisées par Losick et al., pour étudier le rôle d'un allèle hémidominant Naip5 dans l'immunité [30], par Sanders et al. pour montrer le rôle de la flagelline dans l'immunité adaptative [26], et par Neunuebel et al. pour étudier la modulation de la dé-AMPylation de Rab1 par Sidd pendant l’infection par L. pneumophila [90].
D'autres lignées de souris telles que les souris ICR [91], 129X1/Sv [92], les souris Nude déficientes en cellules T [93], les souris F344/DuCrl2Swe [94] et les souris OF1 s [82], ont également été utilisées.
Les souris et les de rats génétiquement définis et génétiquement modifiés sont largement utilisés en recherche pour étudier la fonction de gènes spécifiques, et pour servir de modèles expérimentaux pour différentes maladies humaines. Des milliers de ces lignées sont disponibles, avec une myriade d'altérations des gènes, la sélection de la lignée, et diverses applicabilités.
Les souris P2X7 knock-out de The Jackson Laboratory ont été utilisées pour étudier le rôle du récepteur P2X7 dans la réparation de dans la cornée des blessures de débridement épithéliales in vivo [95], et les souris knock-out pour le gène de la leptine (ob / ob) (Jackson Laboratory) ont été utilisées pour déterminer l'effet de O-GlcNAcylation sur la fonction plaquettaire [16]. Également largement utilisées sont des souris avec d'autres altérations des gènes, telles que la souris Cg-Prkdcscid IL2rgtm1Wjl/SzJ (NOD/SCID-IL2R-/-) [96], IL-6-/ - [60], db / db et db / m [97], TLR2-/ - [26], Huntington R6 / 2 [98], et la souris transgénique OT-2 TCR, B6 Ly5.2 et la souris 129/SvEv micep IFNAR1 déficiente [99].
Un autre rongeur, le rat, est le deuxième modèle animal le plus cité. Par rapport aux souris, les rats sont plus gros, plus féroces et plus résistants contre divers maux. Les rats Sprague-Dawley et Wistar sont deux lignées de rats les plus fréquemment utilisées. Comme pour les lignées courantes de souris, ces deux lignées de rats sont albinos. D'autre part, les deux lignées de rats sont des lignées non consanguines (les lignées de souris les plus couramment utilisés sont des lignées consanguines). Les rats de laboratoire sont de l'espèce Rattus norvegicus, tandis que les lignées de souris de laboratoire proviennent de plusieurs espèces différentes.
Le rat Sprague-Dawley est une lignée albinos hybride avec des têtes longues et étroites. Il a un taux de reproduction élevé et une faible incidence de tumeurs spontanées. Son tempérament calme et sa maniabilité en font un modèle de choix pour les scientifiques et techniciens de laboratoire. Labome a revu 8 publications sur les rats Sprague-Dawley comme modèles animaux, la plupart d'entre eux provenaient de Charles River.
Dans la recherche neurobiologique, Ewert et al. ont étudié l'effet de l’hyperactivité sympathique cardiaque post-infarctus sur l'expression de la galanine dans les rats adultes Sprague-Dawley [100], Surgucheva et al. ont préparé des cellules rétiniennes de rat à partir de rats Sprague-Dawley pour évaluer gamma-synucléine comme marqueur de cellules ganglionnaires de la rétine [101], Zhou et al. ont étudié l’expression du facteur neurotrophique dérivé d’une lignée de cellules gliales dans les extrémités rostrales et caudales de moelles épinières sectionnées de rats adultes Sprague-Dawley [102], et Schafe et al. ont étudié la potentialisation à long terme dans des rats Sprague-Dawley mâles adultes naïfs in vivo [103]. Dinieri et al. ont mené des études de transfert de gènes viraux chez des rats Sprague-Dawley pour étudier la sensibilité altérée aux médicaments enrichissants et aversifs chez la souris avec une interruption inductible de la fonction de CREB dans le noyau accumbens [104], et Chen et al. ont implantés des rats Sprague-Dawley avec des canules unilatérales dans l’hypothalamus dorsomédial pour étudier le rôle de DMH CCK dans la prise alimentaire [105].
La pathologie est un autre domaine où les rats Sprague-Dawley ont été utilisés. Reungjui et al. ont placé des rats Sprague-Dawley sur différents régimes potassiques pour déterminer si la néphropathie hypokaliémique implique une insuffisance de l'angiogenèse rénale [106]. Buchholz et al. ont infecté des rats Sprague-Dawley avec Plasmodium berghei pour étudier le rôle cellulaire de Plrx dans son cycle de vie [36].
Le rat Wistar est une autre lignée albinos hybride. Il a l'honneur d'être la première lignée de rat développé pour servir de modèle animal. La lignée de rats Sprague-Dawley est dérivée de cette lignée.
Labome a revu 6 publications employant des rats Wistar. Woo et al. ont utilisé des rats Wistar mâles pour développer un modèle mécanistique de l’anémie induite par la chimiothérapie [107]. Siniscalco et al. ont étudié le rôle de la caspase-7 dans l’apoptose associée à la douleur chez les rats mâles Wistar [108]. Aprigliano et al. ont isolé des cellules étoilées du foie à partir de rats Wistar pour étudier l'effet de l'atorvastatine sur l'apoptose [109]. Maddahi et al. ont induit des lésions cérébrales ischémiques chez les mâles Wistar-Hanover rats (Mollegaard Elevage Centre) pour étudier le rôle de la voie MEK / ERK dans l'expression de récepteurs après une lésion cérébrale ischémique [110]. Unkrüer et al. ont induit un état épileptique chez les femelles de rats Wistar Unilever pour déterminer la distribution cellulaire de la protéine YB-1 dans le cerveau de rats adultes, des macaques et des êtres humains [111]. Matrone et al. ont obtenus des embryons à partir de femelles Wistar afin d'étudier le rôle de la signalisation du NGF ou BDNF dans la mort par apoptose neuronale [112].
The Jackson Laboratory, fondé par Clarence Cook Little, qui a produit la lignée de souris consanguines C57BL, entre autres, est le fournisseur d’animaux expérimentaux murins le plus cité. Plus de 5.000 lignées de souris sont disponibles à partir de The Jackson Laboratory. Il maintient également une source d'information intégrée des souris. En 2011, il a distribué 3,0 millions de souris à "environ 20.000 chercheurs (ou laboratoires) dans plus de 900 institutions dans au moins 50 pays."
Plus de 143 publications revues par Labome citent The Jackson Laboratory en tant que source. Il est la principale source pour les lignées de souris courantes comme C57BL, BALB/c, et des lignées de rats et de lignées moins communes comme DBA/2J [10], C3H.SW (H-2b) [18], NOD/ShiLtJ [113], AKR/J (AKR) [25], FvB/NJ [30], C3H/HeJ (C3H), C58/J (C58) et CBA/J [25], 129 X1/SvJ [70], et MRL/MpJ [114].
Beaucoup de lignées de souris congéniques et transgéniques proviennent également de The Jackson Laboratory, comme CD8-KO et PFP-KO [29], ASKO [115], beta-cateninf/f, CMV-Cre, Rosa26R, Flk1LacZ/+ et TOPGAL [116], RAG-/- [32, 54], IFN-/- [32], B6.129P2-Tcrdtm1Mom/J [33], p53 heterozygote [41], C3H/HeJ-Hmx1mpe/J [117], GM-CSF/IL-3/IL-5 récepteur déficient [118], TLR3KO [113], OVA323-339 TCR transgénique [119], N-Tg (Thy1-cre) 1Vln/J et Gt (ROSA) 26Sortm1 (eYFP-Cos) [120], DO11.10 TCR transgénique [121], Tlr2-/- [54], albumine-CRE [122], SIRT6-/+ hétérozygote [123], dystrophine déficiente [124], et Npc1 hétérozygote [124],
Charles River a fourni des animaux de recherche depuis plus de 60 ans. Parmi les publications revues par Labome, 54 publications ont citées Charles River comme source. Il est le principal fournisseur pour les lignées courantes comme C57BL, BALB/c, et d’autres lignées comme B6C3F1 [125], DBA/2 [39], TNF-alphaR1KO [126], souris Nude [127] et NMRI [36]. Il fournit également la majorité des souris CD-1 et des lignées de rat citées dans les publications revues.
Taconic Farms a fourni des rats et des souris génétiquement définis depuis plus de 50 ans. Dans les publications revues par Labome, 23 publications ont citées Taconic comme source. Outre les lignées courantes comme C57BL, Taconic fournit les souris DPP-IV-/- [49], RAG-2-/- [23], [121], RAG1-/- [44], Egr1-/- [52], [53], NCR Nude [128], et les souris transgéniques TNFalpha [129].
Vingt publications ont citées Harlan Laboratories en tant que fournisseur pour leurs animaux. La ferme de reproduction célèbre Sprague-Dawley à Madison, dans le Wisconsin, où la lignée de rat du même nom, Sprague Dawley, a été initialement élevé, fait maintenant partie de Harlan. Harlan fournit des souris Hsd Nude [128], des rats WKT et LEW [130], et des souris SJL/J [60].
Japan SLC fournit des souris ICR [91], B6 [131], et B10.D2 [118].
Les autres fournisseurs comprennent les agences gouvernementales comme le National Cancer Institute [69], des organisations comme Texas Institute of Genomic Medicine [132], et des fournisseurs commerciaux tels que geneOway [133], Lexicon Pharmaceuticals Inc et MSD Pharmaceutical [134].
IMSR est une collaboration d'une douzaine de databases internationales de souris, contenant des informations sur 25,104 lignées et 210 178 lignées cellulaires EC (Avril 2013). Pour exemple, voici 158 lignées de gène p53 de la souris. Le site est soutenu par une subvention du NIH.
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